解螺旋大众号·陪同你科研的第2135天
肿瘤医治的“矛与盾”
前面咱们的推送里,向咱们介绍了Cancer Cell的一篇文章,文章拦路虎了肿瘤细胞多样性对微环境的影响,肿瘤细胞多样性越高,具有的生计也越差。
如果把肿瘤细胞比作“矛”,那么免疫系统便是咱们体内天然存在的“盾”了。
今日给咱们介绍的一篇文章便是讲“盾”的多样性关于肿瘤医治的重要性了。
文章是由华中科技大学武汉协和医院的研讨团队于2019年宣布在International Journal of Cancer(ps:这杂志影响因子不安稳啊,17年7.3分,18年4.98分)。
文献:
Characteristics and prognostic significance of profiling the peripheral blood T-cell receptor repertoire in patients with advanced lung cancer.
这项研讨共纳入了64名肺癌患者和31个健康人,其间18名患者为复发患者。
研讨人员收集一切具有医治前的血液和26个具有在医治后的血液。
使用免疫组库检测技能对外周血中TCR的CDR3区域进行测序来判别TCR受体多样性。
这儿和咱们解说下,T/B细胞外表受体(TCR/BCR)有一块区域叫互补决议区(Complementary Determining Region, CDR),包括CDR1、CDR2、CDR3。
其间CDR3的改动程度最高,在抗原辨认中也起关键作用。
所以也就不难理解CDR3的多样性越高,辨认抗原的才能也就越强,免疫系统越能对“异己”分子发生呼应。
免疫组库技能便是使用高通量测序技能研讨TCR/BCR编码基因多样性的技能。
研讨成果发现在肿瘤具有中TCR CDR3的克隆类型数目(clonotype)和多样性分数(diversity)比健康对照组低了不少。
详细来看(c、d图),J基因在肿瘤患者中的频率要显着的低一些,V基因则是大部分为健康对照组的频率高,少部分相反。
整体而言,肺癌具有外周血TCR组库和健康人有着显着的差异。
然后研讨人员比较了不同临床要素对免疫组库特征影响,发现肿瘤的巨细和搬运的器官数目都对克隆数目和多样性分数有着显着的影响。
肿瘤越小的具有,其克隆数目和多样性分数越高,肿瘤搬运的器官越少,其克隆数目和多样性分数也会越高。
他们还拿克隆数目和一些血液目标做了个相关性剖析,发现中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)和乳酸脱氢酶(LDH)和免疫组库目标之间存在显着的负相关。
做肿瘤研讨久了就有一个思想定式——“***操作能够短兵相接具有预后么?”。
咱们咱们能够看到大部分能够取得耐久临床获益(DCB)的具有都有着正向的多样性改动(a图此处其实能够做个卡方查验看看散布的计算差异)。
术前术后TCR的overlap和预后也有着显着的相关性(b图此处也能够做个相关性查验,难道不显着??看着应该是显着的)。
一起研讨人员将术后diversity进步10%或许diversity安稳但有高的overlap的具有界说为“immune improved”。
成果发现,多样性显着升高或许有着高overlap或许immune improved的具有预后显着得到进步(ps:这个配色就很不科学了,要吐槽下了,升高箭头组、high overlap组为毛是蓝色的?雨过天晴没有逻辑过错,可是反人类直觉!)。
总结全文来看,免疫组库的多样性越高,越能反抗肿瘤,越能短兵相接具有预后。
这让笔者想起了高中的生物学课,生态系统越是杂乱,生产者、顾客成分越是杂乱,越能反抗外来要素的影响,看来免疫系统也是这样。
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