耐药菌FMT逝世患者信息发布；妊娠期用扑热息痛与孤独症相关

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共享一周人体微生态及公共卫生相关前沿新闻

01

新格兰医学杂志：FMT致死患者，确实没有经过专门的ESBL大肠杆菌检测

研讨称号：Drug-Resistant E. coli Bacteremia Transmitted by Fecal Microbiota Transplant

期刊：New England Journal of Medicine

宣布时刻：2019年10月30日

IF：70.67

DOI:10.1056/NEJMoa1910437

不知你是否还记得本年6月份FDA发布的“FMT（粪菌移植）有必要严厉筛查耐药菌”的正告：

在一起实验性质的FMT过程中，2名患者受体呈现耐药菌感染，其间1名逝世，而这2名患者的供体来自同1名捐赠者。捐赠者的粪便样本随后被检出含产ESBL大肠杆菌。

点图回忆《1名承受FMT的患者逝世，FDA发文正告粪菌移植危险》

其时，担任监督这两项实验的查询人员在发现FMT或许传达耐药菌后，当即通知了美国FDA和安排监督委员会。10月30日，马萨诸塞州总医院于《新英格兰医学杂志》上具体发布了这2例患者的状况。

在文章中，研讨人员标明，因为耐药菌的挑选直到2019年1月才进入流程，而这批FMT所用的胶囊生产于2018年末——所以，其时的供体粪便，确实没有经过专门的ESBL大肠杆菌检测。

其间1名患者呈现耐药菌感染后，承受了静脉注射抗生素，并得到了治好；

另一名患者参加的是一项旨在改进白血病干细胞移植前后肠道微生物群的研讨，患者于干细胞移植前后服用FMT胶囊，术后5天呈现ESBL大肠杆菌感染，虽然进行了活跃医治，但因感染相关并发症逝世。

细菌的基因检测成果，已确认供体粪便为患者感染源。这项研讨，是与FMT胶囊耐药菌搬运直接相关的患者逝世事情。它提示各位研讨者，严厉的捐赠者筛查是防备患者感染的重要手法，特别关于那些免疫功用受损的患者。

纽约大学医学院微生物学教授、《消失的微生物》作者Martin J. Blaser于在同期配评中写道：

“两位患者有严峻的潜在疾病，一位是肝硬化兼并肝性脑病，另一位是造血细胞移植医治的血液反常增生。这两名患者一起运用和曾经运用的抗生素，对肠腔细菌具有广泛的对立性，削弱了本来可以对立病原体的微生物群。

到现在为止，FMT的并发症并不常见。关于复发性困难梭菌感染，FMT的好处显着大于危险；可是，跟着FMT运用规模的扩展，并发症或许会更频频地呈现。因而，临床实验有必要精心设计，细心权衡好处和危险以确认适应症。

短期内，咱们应该针对FMT进行改进和一致的挑选（包含细菌、真菌、原生动物、病毒、细胞因子和代谢物），科学家有必要确认哪一种物质是有利的，以下降FMT的危险。

别的，还应该考虑怎么改进供体和宿主的匹配，包含独自给予某种活性成分。一个重要的方向是——开发有针对性的益生菌/元组合，但也应考虑包含噬菌体在内的代替计划。关于复发性困难梭菌感染的医治，还应开发针对困难梭菌的窄谱药物。”

02

胃肠病学：西式饮食易致肠癌复发，调度肠菌可下降危险

研讨称号：Western Diet Promotes Intestinal Colonization by Collagenolytic Microbes and Promotes Tumor Formation Following Colorectal Surgery

期刊：Gastroenterology

宣布时刻：2019年10月23日

IF：19.233

DOI:10.1053/j.gastro.2019.10.020

因为技术前进和医治计划改进，结直肠癌患者的预后现已前进了不少。可是，即便进行彻底的病理切除，许多患者仍存在肿瘤部分搬运或远端搬运的状况，其潜在机制仍不清晰。

其间，西式饮食（高脂、无纤维、矿物质和维生素削减）是结直肠癌复发一个已知的要素。

一支芝加哥大学等安排的研讨小组近来于《Gastroenterology》发文，他们研讨了西式饮食促进结直肠癌切除小鼠肿瘤复发的机制，并特别调查了小鼠微生物组分的改动。

他们发现，给小鼠食用西式饮食和运用抗生素，可以促进结直肠癌术后吻合口处的肿瘤复发，复发份额高达88%；

而平等条件下食用规范餐的小鼠，复发率则降至30%。

科学家们进一步发现，结肠肿瘤的构成与溶胶原酶和Proteus mirabilis菌的存在有关。抗生素的运用虽然消除了溶胶原酶和Proteus mirabilis菌，但也促进了胶原酶发作菌假丝酵母菌Candida parapsilosis的呈现。

可是，当科学家不给小鼠运用抗生素，而是服用Pi-PEG（它按捺细菌发作胶原酶，但不按捺细菌成长），则能削减肿瘤的构成，并保持结肠微生物的多样性。

这阐明，防备特定微生物群的呈现或运用酶活性战略，可用于下降结直肠癌手术患者肿瘤复发的危险。

03

JAMA子刊：妊娠期用“扑热息痛”，与子孙患ADHD和孤独症的高危险有关

研讨称号：Association of cord plasma biomarkers of in utero acetaminophen exposure with risk of attention deficit/hyperactivity disorder and autism spectrum disorder in childhood

期刊：JAMA Psychiatry

宣布时刻：2019年10月30日

IF：15.916

DOI:10.1001/jamapsychiatry.2019.3259

10月30日，《JAMA Psychiatry》刊登了一则由约翰霍普金斯大学医学博士王晓兵及其搭档发布的行列研讨成果：子宫内的对乙酰氨基酚露出，或与ADHD和ASD有关。

乙酰氨基酚， 也便是咱们俗称的“扑热息痛”，一直以来都是美国FDA仅有认可的、可在整个孕期内安全服用的止痛药。

这项由美国国立卫生研讨院和孤独症研讨所赞助的行列研讨标明，妊娠期内的乙酰氨基酚露出，有或许添加孩子患留意缺点/多动妨碍（ADHD）和孤独症谱系妨碍（ASD）的危险。

研讨人员剖析了波士顿出世行列中、996名新生儿的脐带血的数据，并测量了每个样本中对乙酰氨基酚及其两种副产品的含量，依据含量由高到低，将其分为A、B、C三组。

当这些孩子均匀长到8.9岁时，有25.8%被确诊为ADHD，6.6%被确诊为ASD，4.2%被一起确诊为ADHD和ASD。样本比对发现，

A组程度的对乙酰氨基酚露出，与2.86倍的ADHD危险有关；

B组程度的对乙酰氨基酚露出，与2.26倍的ADHD危险有关；

并且，A组（3.62倍）和B组（2.14倍）都有明显更高的ASD患病危险。

因为该研讨归于行列研讨，所以咱们暂时无法知道这两者是否存在确认的因果关系。但这项成果与部分前期研讨的定论相符，它强调了进一步研讨在妊娠期运用对乙酰氨基酚的安全性。

在FDA发布更新的用药攻略之前，主张怀孕期间慎重运用任何止痛药物。

04

柳叶刀子刊：肿瘤可将“肠胶质细胞”转化为自己的成长促进剂

研讨称号：Tumor cells hijack enteric glia to activate colon cancer stem cells and stimulate tumorigenesis

期刊：EBioMedicine

宣布时刻：2019年10月28日

IF：6.68

DOI:10.1016/j.ebiom.2019.09.045

肠胶质细胞（EGCs）是肠道神经系统中的一部分，协助调理重要的肠道功用。

10月28日，北卡罗莱纳州立大学宣布于《EBioMedicine》的研讨发现：当肠胶质细胞露出于结肠肿瘤的分泌物时，胶质细胞可转化为肿瘤成长促进剂。

研讨人员标明：“当癌细胞在肠道内成长时，肿瘤会发明一个由周围EGCs、神经元、血管、免疫细胞和各种信号分子等常驻或招募细胞组成的肿瘤微环境。肿瘤与周围微环境不断相互效果。而现在只要结肠癌干细胞（CSCs）被以为可以发作肿瘤”。

当他们将CSCs露出于EGCs的分泌物中时，发现EGCs可以独自成长，并且与肿瘤无关；当在成长肿瘤细胞的同一培育基中培育EGCs，然后将这些分泌物露出于CSCs中时，肿瘤构成得更快，体积也更大——这阐明，肿瘤实际上重塑了邻近的胶质细胞，意图是让自己茁壮成长。

这项作业证明了肠胶质细胞在肿瘤微环境中的重要性，并有或许为结肠癌的医治带来新的靶点。

EGCs影响CSC驱动肿瘤的发作

05

Science：免疫细胞的发育，依赖于生命前期微生物群的“定植窗口”

研讨称号：MAIT cells are imprinted by the microbiota in early life and promote tissue repair

期刊：Science

宣布时刻：2019年10月25日

IF：41.037

DOI:10.1126/science.aax6624

咱们现已知道，微生物群对促进免疫系统的老练和稳态起重要的效果，特别是在生命前期。

MAIT细胞是人类首要的先天性类淋巴细胞亚群，它们首要坐落微生物群定植的安排中，在人和小鼠皮肤中特别丰厚，而这种免疫细胞特别依赖于微生物群。

在这项研讨中，贝塞斯达国立卫生研讨院的科学家们决议对MAIT细胞促进安排生理学的程度一探终究。

他们发现，MAIT细胞在2-3周龄时就已积聚在屏障安排中，证明它们在特别的窗口期对微生物的定植有所呼应；相反，微生物群在生命后期的定植，未能促进这些免疫细胞在安排内的发育。

这项研讨阐明：微生物群露出，有必要发作在生命前期的“窗口期”，它们对MAIT细胞具有至关重要的效果。

生命前期的微生物群露出决议了MAIT细胞的丰度，MAIT细胞功用遭到与微生物群相互效果的调理

本周 HEADLINE 回忆

06

Nature重磅：肠道菌怎么影响大脑，协助消除惊骇相关的行为

10月下旬，《Nature》刊载了一种存在于“肠道微生物-脑细胞”间史无前例的细胞和分子沟通机制。简略来说，即微生物群的改动可以对神经元功用和与学习相关的可塑性发作适当大和耐久的影响，进而能调理惊骇衰退行为。

依据该研讨，这种衰退衰退学习的缺点与mPFC的功用妨碍相关，特别是兴奋性神经元的功用妨碍；而微生物群或许是经过循环的微生物源性代谢产品来影响中枢神经系统，并直接影响mPFC中的兴奋性神经元，导致衰退性学习妨碍的，而非迷走神经。此外，微生物源性代谢物还或许影响mPFC中的其他细胞亚群（如小胶质细胞），直接影响兴奋性神经元和行为。

这些发现将咱们对肠-脑间联络的了解推到了史无前例的广度和深度；因为认知和突触可塑性的改动在简直存在于一切的神经精神疾病中，这一研讨也提醒一条将当时的发现转化为临床发展的或许途径，其潜在的运用规模适当广泛；例如相关性最高的伤口后应激妨碍的医治。

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07

睡觉浅、易吵醒、反响慢，或许是肠道菌的锅，初次证明菌群-睡觉-免疫-认知存在相关

研讨称号：Gut microbiome diversity is associated with sleep physiology in humans

期刊：PLOS ONE

宣布时刻：2019年10月

IF：2.776

DOI:10.1371/journal.pone.022239

依据近期《PLOS ONE》刊载的一篇最新研讨，改进肠道菌或许能让咱们收成长时刻的高质量睡觉。

简略来说，依据该研讨，微生物的整体多样性与睡觉功率、总睡觉时刻以及白细胞介素-6（IL-6）呈正相关，与入眠后的复苏呈负相关；包含Lachnospiraceae、Corynebacterium、Blautia在内的几种微生物与睡觉质量呈负相关；不良睡觉则会直接对肠道菌群发作负面影响。

这一研讨成果初次确立了肠道微生物组组成、睡觉生理学、免疫系统和认知之间的联络；为未来经过肠道微生物来改进睡觉奠定了根底。

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08

知几工业研报：几家欢欣几家愁，百亿微生态药物工业的沉与浮

此前，咱们曾剖析药企巨子入局微生态，企图经过与微生态草创企业的结合，从微生态视点抢占肿瘤免疫疗法的下一轮先机。还介绍过粪菌银行在微生态药企的压力下寸步难行，运营困难，很或许被活体生物药代替，底子没有未来。

这无一都预示着：药物，已是微生态最具价值的发展方向之一。

据不彻底统计，全球规模内超越30家微生态药企融资超越19亿美金。其间，2019年就有近10亿美元砸向了Finch Therapeutics、Vedanta Biosciences、Azitra、Biomx、DayTwo等公司。

截止现在，微生态药物有上百个管线在研制，但仍无一成功。以Finch Therapeutics、Seres Therapeutics、Vedanta Biosciences为代表的微生态药物创业明星虽然在本钱层面融资不断，但职业里连续失利的管线以及不确认的未来、昂扬的科研投入，现已给职业蒙上了一层不确认的颜色。

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22种癌症相关消化道菌群：筛查、确诊和预后标志物

在生物医药界，肠道微生物群是癌症医治革新的后起之秀。

就在曩昔5年中，“Oncomicrobiome”（肿瘤菌群）一词开端用来指代这一炙手可热的研讨课题。科学家们正逐渐承受这一现实：生活在人类消化道中、数以万亿计的细菌、真菌、病毒等微生物，也许是一个免疫肿瘤学的新靶点，具有为癌症患者开发新疗法的潜力。

现实上，各大尖端医学期刊所宣布的小鼠和人类实验陈述，现已开始提醒了肠道菌群在癌症中的效果。

比方，肠道菌群协助对立肿瘤：

2013年，Zitvogel的研讨小组发现，化疗药物环磷酰胺会损坏肠道的黏液层，使一些肠道细菌进入淋巴结和脾脏，然后激活特定的免疫细胞。而关于那些运用抗生素消除肠菌的小鼠来说，这种药物基本上失去了抗癌效果。

两年后他们于《Science》宣布的陈述进一步发现，给予小鼠口服软弱拟杆菌Bacteroides fragilis，可以提高它们对癌症免疫医治药物（检查点按捺剂）的呼应。

跟着癌症免疫疗法的爆炸性增加，科学家们也正在更详尽地研讨肠道微生物群怎么与抗癌药物相互效果，以及咱们应该怎么使用这些效果。

其间，最惊喜的一些发现，来自肠道菌群作为“癌症筛查、确诊和预后标志物”的潜力。

值得留意的，除了断直肠癌之外，肠道微生物群的改动对一些远端器官癌症（比方肝癌、胰腺癌）也具有明显效应。

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